Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nmd3Q99L48 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nmd3Q99L48 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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