Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Derl1Q99J56 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms