Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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