Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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