Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ScocQ78YZ6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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