Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Thsd7bQ6P4U0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Thsd7bQ6P4U0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Thsd7bQ6P4U0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Thsd7bQ6P4U0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd7bQ6P4U0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd7bQ6P4U0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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