Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms