Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms