Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf12Q5SPL2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf12Q5SPL2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms