Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc27Q3V036 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms