Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b2Q3UJB0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms