Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll12Q3UDE2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms