Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms