Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms