Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms