Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Saa4P31532 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Saa4P31532 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Saa4P31532 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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