Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms