Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde6aP27664 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms