Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NefhP19246 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms