Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm10509O88255 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm10509O88255 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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