Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd2O54851 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms