Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ptpn9O35239 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ptpn9O35239 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ptpn9O35239 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ptpn9O35239 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ptpn9O35239 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ptpn9O35239 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptpn9O35239 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms