Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms