Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Gm28038F7BCN9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Gm28038F7BCN9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gm28038F7BCN9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gm28038F7BCN9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gm28038F7BCN9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Gm28038F7BCN9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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