Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NhsB1AV60 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NhsB1AV60 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms