Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrit3W8DXL4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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