Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms