Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms