Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms