Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms