Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms