Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms