Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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