Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms