Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms