Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhbdd2Q8VEK2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms