Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms