Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmx1Q8VBT0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms