Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms