Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms