Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zbed4Q80WQ9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed4Q80WQ9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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