Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AknaQ80VW7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AknaQ80VW7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms