Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Senp6Q6P7W0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms