Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms