Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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