Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek10Q3UGM2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms