Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms