Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms