Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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