Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms